1.RDKit——化学信息学库

• 一个开源的化学信息学库，提供了分子操作、描述符计算和化学反应模拟等功能。
• 安装命令：

pip install rdkit

2.mordred——分子描述符计算包

• ，支持超过 1800 种分子描述符的计算，适用于化学信息学和机器学习任务。
• 安装命令：

pip install mordred # mordred-community

3.molli——denmark 组开发的工具库

处理像那 1075 个反应这样的大规模组合化学库。这个库里通常包含处理 .mol2/.xyz 文件的脚本，以及生成他们核心描述符（AAVG/AEIF）的代码

• 从纯 CDXML 文件生成具有立体化学精度的组合库，以及并行计算接口
• 完整表示分子图、几何和几何集合，且无隐式原子

3.PyMOL——分子可视化工具

• 一个强大的分子可视化工具，广泛应用于生物化学和药物设计领域。
• 安装命令：

4.DGL——深度图神经网络库

40 系以前的显卡可以用，50 系显卡不用尝试了——太久没更新了，cuda 不支持，注定无法安装

5.DeepChem——化学深度学习库

• 一个专注于化学和材料科学的深度学习库，提供了丰富的工具和模型。
• 安装命令：

pip install deepchem

6.ChemProp——分子属性预测工具

• 一个基于图神经网络的分子属性预测工具，适用于药物发现和材料设计。
• 安装命令：

pip install chemprop

7.RXNFP——反应指纹生成工具

• 一个用于生成化学反应指纹的工具，基于深度学习技术。
• 安装命令：

8.tmap——高维数据可视化工具

• 一个用于高维数据可视化的工具，适用于化学和生物数据分析。
• 安装命令：